分子蒸餾實現真空度控制采用閉環控制，液環真空泵與旋片式真空泵需要讓真空度維持在負壓的情況之下，通過串聯氣體流量控制器設備,充分利用氣體流量控制器來保持分子蒸餾器的真空度實現穩定效果。

  分子蒸餾器將上端的真空表換成為數字真空表，將采集到數據直接傳輸到總閥中，通過它控制真空泵達到預定真空度，由于真空泵由液環真空泵與旋片式真空泵組成，冷卻水的流量的穩定性會影響到真空泵的運轉，因此真空泵的穩定性比較差，波動是比較劇烈的，比如小型蒸餾設備，蒸發器直徑比較小，受到真空度波動影響大些，這時當蒸發器內的真空度達到預定值的規定范圍，開啟氣體質量流量控制器使它不斷抽氣或是送氣，根據預定值與真空儀實際之間的誤差,通過控制誤差來減小誤差達到真空度上比較穩定的目的。